Predicción de la estructura secundaria y terciaria de GNL3L mediante herramientas computaciones


Authors

  • Juan Felipe Cardona Arango Instituto Tecnológico Metropolitano
  • Sarah Rothlisberger Instituto Tecnológico Metropolitano

DOI:

https://doi.org/10.22517/23447214.12791

Keywords:

Análisis computacional de secuencias, bioinformática, estructura proteica, homología

Abstract

GNL3L es una proteína poco caracterizada perteneciente al grupo de las Nucleostaminas. Sus funciones han sido asociadas principalmente a la génesis de los ribosomas, aunque recientes investigaciones la han asociado con la regulación del ADN telomerico, actuando como proteína accesoria facilitando la formación del complejo shelterina que protege el telomero. Actualmente no existen estudios experimentales que hayan definido la estructura cristalina de GNL3L, lo cual es importante para entender cómo actúa en el proceso de regulación de la longitud de los telómeros. En este trabajo, mediante herramientas computacionales (GOR, SOPMA, PSIPRED) se predice que GNL3L está compuesta en promedio de 52% de hélices alfa y 10% extended strands, lo cual permite inferir que la proteína es principalmente helicoidal. Se obtuvieron 5 modelos de estructura terciaria usando el programa MODELLER, de los cuales se optimizó el mejor con 3Drefine, se validó y graficó con ProSA-web.

Downloads

Download data is not yet available.

Downloads

Published

2016-09-30

How to Cite

Cardona Arango, J. F., & Rothlisberger, S. (2016). Predicción de la estructura secundaria y terciaria de GNL3L mediante herramientas computaciones. Scientia Et Technica, 21(3), 286–291. https://doi.org/10.22517/23447214.12791

Issue

Vol. 21 No. 3 (2016)

Section

Bioingeniería

License

Copyrights

The journal is free open access. The papers are published under the Creative Commons Attribution / Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International - CC BY-NC-ND 4.0 license. For this reason, the author or authors of a manuscript accepted for publication will yield all the economic rights to the Universidad Tecnológica of Pereira free of charge, taking into account the following:

In the event that the submitted manuscript is accepted for publication, the authors must grant permission to the journal, in unlimited time, to reproduce, to edit, distribute, exhibit and publish anywhere, either by means printed, electronic, databases, repositories, optical discs, Internet or any other required medium. In all cases, the journal preserves the obligation to respect, the moral rights of the authors, contained in article 30 of Law 23 of 1982 of the Government Colombian.

The transferors using ASSIGNMENT OF PATRIMONIAL RIGHTS letter declare that all the material that is part of the article is entirely free of copyright.  Therefore, the authors are responsible for any litigation or related claim to intellectual property rights. They exonerate of all responsibility to the Universidad Tecnológica of Pereira (publishing entity) and the Scientia et Technica journal. Likewise, the authors accept that the work presented will be distributed in free open access, safeguarding copyright under the Creative Commons Attribution / Recognition-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International - https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es license.